Специфика 1С

Клиент-серверные приложения потому так и называются, что данные (лежащие на сервере) отдельно, а программа (клиент), которая с ними работает отдельно. В DOS-овские времена также было, но тогда даже предположить что-то другое было сложно. Access (с его связанными таблицами) работает также.
1С – исключение из этого правила. Конфигурацию (программу) без данных из него ещё можно извлечь, а отдельных данных в нем нету.
Но общепринятые правила возникли из стандартной работы. Довольно естественно, что у каждого «отдела» своя программа. Зачем меню засорять чужими пунктами? Пункты можно скрыть? Можно, но всё для всех отдельно это просто удобно и по-своему логично. К тому же есть возможность в любой момент обратиться к данным в другой базе, если это вдруг надо.
По соображениям это общепринятой логичности скорее всего и разбили на две конфигурации. А может разные люди писали. Мало ли что могло быть причиной.
У общего варианта есть ранее не озвученный плюс. Обычно к коллекции программ для разных отделов есть вариант для руководства. Туда ничего нельзя вводить, но там всё можно смотреть, т.е есть возможность добраться до любого документа, что тоже естественно в варианте для руководства. При двух разных конфигурациях сделать так в 1С не получится.
У единого варианта есть два минуса. Первый - нарушение привил техники безопасности. Чисто теоретически база может разрушиться. Если всё разбито на отдельные куски, то разрушится что-то одно, а не всё сразу. Ни сервер, ни Access такого у меня не делали, а вот Interbase (FDB, GDB) рассыпались. Возможно это страхи из времён 20-летней давности, но такие соображения по умолчанию тоже присутствуют.
Второе – 1С не даёт корректировать тексты, пока кто-то работает. Особо отмечу, что динамическим обновлением пользоваться нельзя. Я – тот человек, к которого после этого рассыпалась база при том, что онЕ утверждают, что так можно. Это означает корректировку утром, в обед, вечером либо необходимость сгонять всех вообще а не один конкретный «отдел». Не знаю, есть ли эта проблема если работать с 1С-ом через Интернет (через браузер). Для отчётов и выборок такой проблемы нет, из можно делать внешними, а для всего остального (формы ввода) так.
Это тот случай, когда не возьмусь судить какой вариант лучше. Может и можно всё в одну конфигурацию засунуть, а опасения вызваны излишним консерватизмом.